Ich kann die Hersteller durchaus verstehen, solche Meldungen anzuzeigen und einige Funktionen abzuschalten. Wenn du jetzt ein Problem mit der App hast und dich an den Hersteller wendest, ist die Fehlersuche bei einem gerooteten Smartphone viel schwieriger. Die offiziellen Version von iOS und Android kann der Hersteller verifizieren und die Apps entsprechend testen. Und auch dort kann eine Umgebung wie beim Endkunden meist nicht nachgestellt werden.
Dieser Vorgang ist aber ganz normal. Wenn du eine Software einsetzt, die für dein Betriebssystem nicht freigegeben ist, erhältst du vom Hersteller keinen Support oder es steht nur gewisse Funktionen zur Verfügung.