Das ist genau das Problem bei mir. Mein Auto hat noch nicht mal 25tkm runter und ich habe jetzt im ersten Winter mächtige Probleme mit dem Schalten gehabt. Besonders vom ersten in den 2. Gang. Teilweise habe ich den zweiten fast gar nicht reinbekommen.
Das Problem tritt so ab Temp. unter 5 Grad bei mir auf. Je kälter, desto hakeliger bis gar nicht mehr lassen sich die Gänge schalten. Am schlimmsten betroffen ist der 2. Gang.
Sobald man allerdings ein Weilchen gefahren ist, gehen die Gänge wieder dreutlich besser rein.
Jetzt bei den warmen Temperaturen habe ich sogut wie keine Probleme mehr.
Hab übernächste Woche ein Termin beim Freundlichen. Der hat wohl ne Anfrage an Skoda gestellt und nun wollen die das Problem so schnell wie möglich lösen. Könnte evtl. sein, dass sogar irgendwelche Lager am Getriebe gewechselt werden sollen. Die wollen sich das aber erst mal anschauen.
Ich vermute aber mal ganz stark, dass es ein Viskositätsproblem mit dem Getriebeöl gibt. Hat von euch jemand ähnliche Probleme?
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ich habe GENAU DAS SELBE PROBLEM 
fahre zwar ´nen benziner und der hat etwas mehr km auf der uhr und eine kleine vorgeschichte, die noch her muss:
ich habe den RS letztes jahr im warmen sommer bekommen. schaltprobleme waren mir so nicht aufgefallen, alles muss flutschig gewesen sein (wenn ich im nachhinein überlege), denn sonst hätte ich schon längst was unternommen.
im november (bevor der erste schnee fiel), machte meine werkstatt die diagnose: getriebe undicht 
am ende war der wagen beim getriebespezi und es wurde ein neues getriebegehäuse eingebaut.
seit der abholung anfang dezember (da war es dann das erste mal so richtig fett kalt) ist mir dann aufgefallen, dass bei kaltem motor/getriebe das schalten vom 1. in den 2. gang sehr schwer/hakelig u.ä. von statten ging. ist man eine weile gefahren, war alles wieder normal weich zu schalten.
aber auch nur vom 1. in den 2. gang, andersrum und in den anderen gängen flutschte alles.
meine beoachtung war auch, dass sobald 5-4°C und weniger waren, dieses hakelige schalten auftrat.
beim nachfragen beim getriebespezi wurde mir gesagt, es sei schon das dünnflüssigste öl verwendet worden, ie viskosität konnte mir keiner nennen (seltsam, grad der getriebespezi müsste oder sollte doch wissen, was man wo reinkippt).
ich vermute, dass das verwendete getriebeöl nicht optimal für meinen rs ist!
würde mir jetzt, evtl. in abhängigkeit von deiner erfahrung nächste woche, 3l original vw-öl besorgen und das nochmal wechseln lassen.
jedenfalls waren sich getriebespezi und skoda eins, dass man am getriebe nix einstellen könne, um das schaltverhalten zu ändern.
eigentlich kanns ja nur die viskosität sein, denn jetzt, wo es draussen >10°C sind, habe ich dieses problem nicht!